أنشئت في العام 1994م بموجب
القرار الجمهوري رقم (67) لسنة 1994م، وصدر المرسوم المؤقت للجامعة في مايو
1995م .
أهداف الجامعــــة :- تعمل الجامعة من أجل تأكيد هوية الأمّة،
وتأهيلها والاهتمام بالبيئة السودانية وبيئة ولاية القضارف
وتأهيل الكادر القادر على ترقيتها وحل قضايا الولاية المتعلقة
بعلوم الزراعة والموارد الطبيعية وعلوم الطب والأرض.
كليات الجامعة وأقسامها: كلية الاقتصاد والعلوم الإدارية: هي الكلية الأم ونواة الجامعة، أنشئت عام 1992م وأقسامها هي :-
( الاقتصاد .
إدارة
الأعمال.
المحاسبة ) وتمنح البكالوريوس بدرجة الشرف في
أربع سنوات.
وتمنح دبلوم تقنى وسيط عامين في إدارة الأعمال والمحاسبة .
كلية التربية :-
تمنح بكالوريوس الشرف العام في التربيةوالآداب
والعلوم
وقسم الأحياء.
كلية الطب والعلوم الصحية :-
تمنح الكلية درجة البكالوريوس في الطبوالجراحة في ست سنوات.
كلية العلوم الزراعية والبيئية :-
الهدف إيجاد كوادر زراعية مؤهلة على المستويين الجامعي وفوق الجامعي
والاهتمام بأبحاث الزراعة المطرية والمشاكل البيئية لترقية الإنتاج وتشمل
الكلية أقسام :
( الاقتصاد الزراعي والإرشاد . الهندسة الزراعية . وقاية المحاصيل .
التربية وإدارة المحاصيل . البساتين . الإنتاج الحيواني والمراعى ).
كلية العلوم الإسلامية والقرآنية :-
تمنح الكلية درجة البكالريورس في الدراسات الإسلامية والعلوم القرآنية .
الشريعة والقانون . الفقه واللغة العربية .
الدبلومات التقنية :-
مركز الدبلوم التقني القضارف :-
يمنح دبلومات وسيطة لمدة عامين في:
إدارة الأعمال . الدراسات المصرفية. المحاسبة. تقنية المعلومات . وعلوم
الحاسـوب .
مركز لغات القرن الإفريقي :-
يمنح دبلومات في لغات القرن الإفريقي.
مركــز دراسات المــــرأة :-
يختص بدراسة تنمية المجتمعات الريفية ودور المرأة فيها .